改革开放后，山东省济宁市畜牧业取得了快速发展，畜牧业产值已占到农业总产值的近40%。畜牧业从家庭副业生产阶段发展到规模饲养阶段，并向产业化阶段迈进，已成为济宁市农村经济中发展最快、活力最强、潜力最大的产业。目前，济宁市畜牧业正处在由传统畜牧业向现代畜牧业转变的关键时期，要实现畜牧业的新突破，必须突出“四个重点”，抓好“四个转变”。
以大力发展畜牧产业化为重点，抓好传统畜牧业向现代畜牧业的转变一要优化畜产品区域布局，加快产业区的形成。继续实施东猪、中鸡、南水禽、西牛羊的区域生产规划。特别要以市委、市政府确定的发展中南部肉、蛋鸭饲养产业区，西北和东北部奶、肉牛饲养产业区为重点，尽快在肉鸭、蛋鸭、奶牛、肉牛四个畜禽品种方面形成生产基地和强势产业区。二要加快畜禽养殖小区建设，促进畜牧养殖基地的发展。要组织各县市区搞好养殖小区用地和整体规划，加大对养殖小区发展的扶持力度，为规模饲养的发展创造良好的条件，推动养殖业上档次、上水平。三要强化龙头企业建设，推动畜牧产业化发展。发展壮大现有畜牧龙头企业，培植发展新兴畜牧龙头企业项目，推广“公司＋农户＋基地”的带动模式，发展订单畜牧业。四要加大技术推广力度，提高畜牧科技含量。大力推广配合饲料、畜禽品种改良等八大实用技术，引进吸收畜牧高新技术，培植高新技术产业，加强对养殖场户畜牧兽医技术培训，提高从业人员的科学文化素质和饲养水平。五要实施名牌发展战略，大力发展优势特色畜牧产业。要打造在全国叫得响的知名品牌，抢占国内外市场，为济宁市畜牧业发展提供更大的空间。
以保障畜产品质量安全为重点，抓好畜牧业由数量型向质量型的转变首先，要转变饲养方式，推进健康养殖，建立标准化养殖基地。抓好养殖观念的转变，改变人畜共处、畜禽混养的落后状况，解决水质、饲料、粪便的污染，改善养殖环境，尽快建立一批标准化饲养基地，从源头上把住畜产品质量安全关。其次，要实施官方兽医监管制度，建立畜产品质量可追溯体系。在全市规模饲养场实施官方兽医监管制度，在饲养、加工、防疫等生产环节建立养殖档案，实行备案、畜禽标志、防疫标志，规范畜禽及产品的交易、运输，实施责任追究、监督抽检等各项措施，建立畜产品质量安全可追溯体系，实施绿色畜产品认证制度和畜产品加工企业资质认证制度。第三，要完善检测手段，加大对畜产品质量的监控力度。以农业部批准的动物基础设施建设项目为基础，督促各县市区加大投入，进一步完善仪器设备和检测手段，建立畜产品质量安全检测实验室，实施对畜产品质量安全的监控。第四，要搞好检疫工作，强化畜产品市场的监管。在加强屠宰检疫、出境检疫和市场监督的基础上，把检疫工作的重点放在产地检疫上，结合规模饲养场兽医监管和村级防疫员队伍建立，建好畜禽档案，开展好村级防疫员协检工作，力争产地检疫有一个大的突破。
以加强重大动物疫病的防治为重点，抓好由常规防控到依法防控的转变要健全防控机制，依法实施重大动物疫病的防控。各级政府要健全防控机构，完善应急预案，落实防控责任，将防控经费列入财政预算，建立正常的资金拨付制度和保障渠道，避免临时追加到位不及时，影响防控工作的开展。要加快推进兽医体制改革，建立动物疫病防控长效机制。市和县市（区）要建立兽医行政管理、行政执法和技术支持体系，乡镇要加强动物防疫机构建设，建立防疫队伍，稳定和强化基层动物防疫体系，村级要健全动物防疫队伍，配齐村级动物防疫员，搞好管理和技术培训。要加强动物基础设施建设，提高疫病防控水平，进一步加大投入，加强技术人员的调整配备，强化动物疫病防治的手段，搞好疫病监测、监控体系建设，提高疫病防治的整体水平。要加快知识更新，提高兽医技术人员的整体素质。加快市县畜牧兽医技术人员知识更新的步伐，提高乡镇畜牧兽医人员的政治和生活待遇，开展技术培训和业务轮训。
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