2006年，香格里拉县以畜牧业结构调整为主线，以科技进步和体制创新为动力，结合退牧还草重点工程的实施，按照标准化、产业化经营，科学化管理和社会化服务的方针，进一步提高畜牧业科技创新和应用能力，畜牧业产值首次突破1亿元大关。
2006年，香格里拉县把推进畜禽养殖的适度规模化、标准化、生态化作为转变养殖方式的重点来抓，积极引导农牧民由传统养殖向现代畜牧业养殖方向发展，采取规划、示范、引导、强化管理相结合的办法，优化畜牧业区域布局和内部结构，确保了畜牧业稳步、快速增长。据统计部门统计，2006年香格里拉县大小牲畜存栏381839头（只），同比增2%；大小牲畜出栏142898头（只），同比增2.7%；肉类总产9804吨，同比增6%；蛋产量264吨，同比增3.9%；畜牧业产值达10144万元，同比增8.6%。 <
为提高畜产品竞争力，保持畜牧业平稳发展，2006年香格里拉县建立健全了动物防疫措施，制定了科学的免疫程序，全面实行动物防疫目标责任制，严格目标管理，在全县扎实开展动物疫病防治工作。同时，重点抓好屠宰监管，确保入场动物健康、出场肉品安全。深入开展屠宰和养殖环节的监管，加大疫病检查力度，严格屠宰入场的验证关、宰后检疫关、消毒灭源关、无害化处理关，做到了病害动物及动物产品无害化处理率达到100%，确保了入场动物的卫生健康和肉品的卫生安全。
畜牧科技推广工作是加快畜牧良种化步伐、提高畜牧业经济效益的重要措施。2006年香格里拉县畜牧改良工作以推进畜牧养殖适度规模化、标准化为重点，充分利用畜牧业资源优势，坚持边建设、边规范的原则，采取示范、引导相结合的办法，提高了草食畜的出栏率和商品率，增加了养殖效益，使畜牧科技推广工作逐步走上规范化发展道路，推动了香格里拉县畜牧业产业化生产和专业化经营。去年，香格里拉县引进了短角肉牛、荷斯坦奶牛、波尔山羊、美力奴绵羊等优良品种，并加大力度完成猪、牛、羊的改良配种工作，良种覆盖率达到了23%。
香格里拉县还充分利用草地资源丰富这一优势，把草地建设作为发展草食畜的基础工作来抓，大力开发饲料青贮和秸杆氨化饲料，2006年共完成青绿饲料种植10000亩、青贮饲料推广10780吨、秸杆氨化推广1400吨。
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